Research

Skills | Yuichi's website

Behavioral experiments / 行動実験

Behavioral training

Operant tasks: Nose poke for reward delivery with footshock.
オペラント条件付けなど行動実験と電気生理学記録とを組み合わせることで、ある行動に特異的な脳活動を抽出可能です。

Keywords: Reward, Punishment, pyControl, NI DAQ, OpenEphys, Amplipex

Behavioral measurements​

Open Field Fest, Elevated Plus Maze, Conditional Place Preference, Linear track, Sensory test

Keywords: Free Moving, DeepLabCut

Neural activity recording / 神経活動の記録

In vivo electrophysiology

Chronic large-scale silicon probe or wire electrode recordings from freely-moving animals. In vivo whole-cell patch-clamp recordings from head-fixed animals.
行動の背後にある神経回路ダイナミクスを記録するため、自由行動下の動物から大規模細胞外記録を行っています。麻酔下または覚醒下で頭部を固定して細胞外記録を行うこともあります。全細胞パッチクランプ記録などの細胞内記録は、頭部を固定した状態で行います。

Keywords: Silicon probes, Local field potential, Single unit recordings, Tetrode recorings, Silicon probe elecordings, Spike sorting, Patch-clamp recordings

In vitro electrophysiology

Slice-patch clamp recordings are used for investigation of synaptic transmissions, synaptic connections etc.
シナプス伝達効率やシナプス結合の配線様式など神経回路の機能構造を詳しく調べたい時は、スライスパッチクランプ法などin vitroの記録を行います。

 

A whole-cell patch-clamp recording from a thalamic neuron in acute slice depolarized with acetylcholine application

Keywords: Whole-cell patch-clamp recordings,  Membrane potentials, Action potentials, Synaptic transmission

Manipulation and intervention of neuronal activities / 神経活動の操作・介入

Optogenetics

For manipulation of neuronal activities in a temporally precise manner.
光遺伝学により、神経活動を高い時間解像度で操作可能です。

Keywords: ChR2, iC++, Laser diodes, Optical cannula, Optorode, Adeno-Associated Virus vectors

Chemogenetics

For continuous manipulation of neuronal activities.
化学遺伝学により、神経活動に長時間介入することが可能です。

Keywords:  hM3Dq, hM4Di, Clozapine N-Oxide, Adeno-Associated Virus vectors

Sonogenetics

For non-invasive manipulation of neuronal activities.
音響遺伝学により、非侵襲的に神経活動に介入することが可能です。

Keywords:  Mechano-sensitive channels, Adeno-Associated Virus vectors

Non-invasive brain stimulation

For human applications. We use focused electrical stimulation and ultrasound stimulation.
ヒトに応用可能な新しい脳活動介入法を研究開発しています。現在は特に超音波を用いたニューロモジュレーション法に注目しています。

Intersectional Short Pulse stimulation: a focused transcranial electrical stimulation technology. (A) Principle of Intersectional Short Pulse (ISP) stimulation. (B) Expansion of ISP technology for multiple focusing points with two distinct stimulus waveforms (green and magenta in the left). After Takeuchi Y and Berényi A, Neurosci Res 2020.

Keywords:  Transcranial Electrical Stimulation, Intersectional Short Pulse stimulation, transcranial Focused Ultrasound Stimulation, Deep Brain Stimulation

Real-time signal processing

For on-demand interventions.
特定脳活動に時空間特異的に介入することで、新しい神経科学的問いに答えようとしています。

Real-time closed-loop interventions of brain activities. After Takeuchi Y and Berényi A, Neurosci Res 2020.

Keywords: Real-time singal processing, Field-Programmable Gate Array

Neuroanatomical methods / 神経解剖学的手法

Immunohistochemistry

For precise localization of molecules in tissues.
免疫組織化学染色法により、標的タンパク質を組織内で可視化することが可能です。

 

Keywords: Antibody, Microtomes, Cryostats

Neurotracing

For morphology of dendrites, axonal projections.
樹状突起や軸索など神経細胞の構造を可視化するため、順行性・逆行性神経トレーサーを用います。

Keywords: Biotinylated Dextran Amine, Cholera Toxin B subunit,  Biocytin, DiI, DiO, DiD, Fluorogold, Wheat Germ Agglutinin

Transgenic animals

For cell-type specific knock-out, knock-in etc.
細胞種特異的な遺伝子導入や遺伝子欠損のため、遺伝子改変動物を用います。

Krox20-Ai14 mice (Takeuchi Y et al, eNeuro 2017)

Keywords: Mice, Rats, Cre-loxP, BAC, CRISPR-Cas9, PCR

Viral vectors

For brain region specific gene transduction.
脳部位特異的な遺伝子導入や遺伝子欠損のため、ウイルスベクターを用います。

Keywords: Adeno-Associated Virus vectors, Lenti-Virus vectors

Other research skills / その他の実験技術

Electronics

DIY if necessary.
必要に応じて工作を行っています。

Keywords: CAD, EAGLE, TINA, Gerber, PCB,  Microcomputer

Repository: figshare

Statistics, Machine learning

Basic biostatistics, Machine learning.
基礎的な統計解析や機械学習を用いています。

Keywords: Biostatistics, Machine learning, Cross-Spectral Factor Analysis

Repository: GitHub

Programming

Python and MATLAB for control and data analyses.
主にPythonとMATLABを用いています。

Keywords: Python, MATLAB, C/C++

Repository: GitHub